在追溯日本人的祖先時，我們往往陷入了歷史的迷霧之中。但是，一項新的研究卻給我們帶來了意想不到的啟示，揭示了日本起源的一個全新視角。

據日媒報道，最近日本理化學研究所的研究團隊負責人寺尾知可史等人通過「日本生物樣本庫」（BioBank Japan）數據，分析了3200名日本人的基因組特點，這些人在日本北海道、東北、關東、中部、關西、九州、沖繩等地的醫療機構登記過。

此次研究發現，日本人的祖先或分為三大系統，分別是在沖繩較多的「繩文系」，在關西較多、與古代中國黃河流域漢族較為接近的「關西系」，以及在東北較多、各種因素混和、不清楚具體由來的「東北系」

另據報道，最早關于日本起源的具體記載，出現在了中國的歷史文獻中。據《后漢書》記載，東漢時期，中國皇帝光武帝曾賜予日本一枚金印，以示對其統治地位的認可。

這枚金印被認為是中國對日本政權的正式承認，也是中國史料中最早關于日本的確鑿記載之一。而在這一段歷史中，「倭奴」一詞的使用，直接指向了中國對日本的統治和影響，這也成為了后世學者研究日本起源的重要線索之一。

此外，在日本的古代史書《日本書紀》中，記載了公元前3世紀秦氏部族從朝鮮遷徙至日本九州：「秦氏，越升國之人，其后世四十人余，乃分徙于肥前（今日本九州北部）。」

這充分說明，日本的祖先極大可能是由朝鮮遷徙過去，但是古代朝鮮的祖先又能追溯到中國黃河一帶，這也不難說明為什麼日本人的DNA會與河南河北的接近。